Appel à échantillonnage de l’œillet des chartreux (Dianthus carthusianorum) et de l’œillet des rochers (Dianthus sylvestris) MALADES et SAINS en France
La période de floraison des œillets commencera bientôt, participez à un programme de recherche !
Dans le cadre d’un programme de recherche franco-suisse « Diversité structuration génétique des populations d’œillets et de son champignon pathogène sexuellement transmissible en France », nous recherchons des volontaires pour échantillonner en France des œillets MALADES et SAINS.
Résumé du projet
L’œillet des chartreux (Dianthus carthusianorum) et l’œillet des rochers (Dianthus sylvestris) sont fortement infectés par son champignon sexuellement transmissible, le charbon des anthères (Microbotryum), à travers la France. Cette maladie se caractérise par la stérilisation de la plante par le champignon par la production de spores violets-noirs à texture poudreuse au niveau des anthères (Figure 1). Ces spores sont ensuite dispersées entre populations via les insectes pollinisateurs (d’où le terme de maladie sexuellement transmissible).
L’objectif de notre étude est d’évaluer la diversité génétique et la structuration génétique des populations d’œillet chartreux et d’œillet des rochers et de leur champignon pathogène associé en France et plus largement en Europe.
La première étape de ce projet consiste en une session d’échantillonnage soutenue de populations infectées d’œillet chartreux et des rochers à l’échelle de la France. Pour cela, nous faisons appel à tout volontaire afin de nous aider dans cette récolte (matériel à récolter : feuilles et fleurs infectées à faire sécher, et si possible, graines).
Comment participer ?
1. Collecter les données
L’échantillonnage consiste en la récolte de populations (1 population = 5 à 30 individus) d’œillet chartreux et/ou œillets des rochers INFECTÉS ou SAINS.
Il s’agira de récolter pour chaque population dans la mesure du possible :
–minimum 5-10 feuilles (mais si possible le plus grand nombre) par plante infectée ou saine (individu) qui seront ensuite séchées à l’air libre.
Chaque individu sera mis séparément dans des enveloppes en papier ou dans du journal et sera répertorié par un numéro/code (au choix) sur le sachet.
Pour chaque site échantillonné, les codes/numéros donnés pour chaque individu seront reportés dans la « fiche de récolte » (une fiche par population et par espèce) ainsi que leurs GPS respectifs (ou nom de la localité) et altitude.
D’autre part, il sera noté dans cette même fiche de récolte si oui on non chaque individu récolté est infecté ou sain et si, dans une même population, les individus infectés et sains co-existent ou non. Cette information est nécessaire pour estimer la prévalence du pathogène chez la plante en France
–2 à 5 fleurs infectées (voir Figure 1: fleurs saines versus fleurs infectées avec anthères violets-noirs poudreuses) qui seront aussi ensuite séchées à l’air libre. Si la plante est saine, il n’est pas nécessaire de récolter des fleurs.
–5-10 graines issues des mêmes individus précédemment échantillonnés (si possible)
Attention, les œillets forment souvent des groupes d’individus difficilement distinguables les uns des autres. Pour l’échantillonnage d’individus bien distincts, nous vous recommandons d’identifier les rosettes de chaque individu pour être sûre que l’échantillonnage soit bien réalisé sur des individus différents.
2. Envoyer vos données
Les échantillons recueillis seront envoyés par la poste (avec la fiche de récolte en version papier associée) à l’adresse suivante :
Dr Amandine Cornille & Hirzi Luqman – projet « Dianthus »
Institut f. Integrative Biologie
CHN G 35.1
Universitätstrasse 16
8092 Zuerich
Switzerland
Ainsi qu’un mail à l’adresse suivante : amandine.cornille[at]gmail.com
Un grand merci par avance pour votre aide !
Botaniquement vôtre,
Amandine Cornille