A :

scan_feuille@t...

De :

Bonnet Pierre <pierre.bonnet@c...>

Sujet :

[scan_feuille] Informations sur l'avancement du projet

Date :

17 Ao�t 2010 11:57

Bonjour à tous,

Voila un peu plus de 2 semaines que l'application portant sur la base 
d'images constituée au cours de l'année 2009 a été ouverte. Un grand 
merci pour vos contributions et retours critiques.

L'administrateur de ce démonstrateur, nous a préparé une première 
synthèse afin (i) de visualiser les images chargées jusqu'à jeudi 
dernier, (ii) nous donner les premiers résultats des tests effectués.

Vous pouvez donc visualiser le travail réalisé à l'adresse suivante: 
http://www-roc.inria.fr/~selmi/plantScan/plantScan_1.html, de préférence 
avec Mozilla Firefox car avec IE vous risquez de ne pas visualiser les 
images.

Voici donc une première synthèse ci-dessous:

84 images ont été chargées.
- Sur 28 images d'espèces qui appartiennent bien à des espèces déjà 
illustrés dans la base d'images, 13 ont été correctement reconnues.
- 57 images chargées n'appartiennent pas à des espèces de la base déjà 
illustrées, et seront donc exploitées pour une seconde phase du projet.

Voici le nombre d'images chargées par espèce:
Acer monspessulanum L. 2 images
Bupleurum fruticosum L. 8 images
Fraxinus excelsior L. 2 images
Paliurus spina-christi Mill. 1 image
Persea americana Mill. 9 images
Populus nigra L. 20 images
Punica granatum L. 5 images
Rhamnus alaternus L. 10 images
Robinia pseudoacacia L. 3 images
Sambucus nigra L. 4 images
Syringa vulgaris L. 2 images
Ulmus minor Mill. 5 images
Vitex agnus-castus L. 10 images
Ziziphus zizyphus (L.) Meikle 3 images

En comparant ces résultats avec les enregistrements que vous avez 
effectués sur la SpreadSheets Google 
(https://spreadsheets.google.com/pub?key=0AsyPCTS-bdYmdEllZi10Q3hKNFZBTE15aVk2OHM1eVE&hl=fr&single=true&gid=1&output=html) 
ont constate que les soumissions d'Annick n'ont pas été enregistrées. Je 
vous propose donc de me les transmettre directement dans un fichier zip, 
afin que je vois si les chargements fonctionnent bien avec vos images de 
mon côté. Vous pouvez charger le fichier zip sur ce site 
(http://dl.free.fr/) ce qui me permettra de le récupérer si celui-ci ne 
passe par mail. Merci.

En ce qui concerne quelques informations sur le contenu des images:
- nous essaierons de faire une extraction des feuilles de Populus nigra, 
afin de ne pas avoir les pièces de monnaies dans l'image,
- nous essaierons également de faire une extraction des feuilles sur les 
images de Ziziphus zizyphus, afin de disposer d'images ne présentant 
qu'une seule feuille par image.
- les recadrages des images sont dans l'ensemble tout à fait adapté, 
nous retoucherons certaines images de Rhamnus alaternus et Bupleurum 
fruticosum, afin de limiter la surface blanche sur certaines images.

Nous souhaitons à cette occasion, vous indiquer le caractère inédit de 
la constitution d'une telle base provenant de plantes, de collecteurs et 
de systèmes d'acquisition aussi différents.
Cette base présente ainsi un intérêt scientifique pour toute la 
communauté et donc pas seulement nous. Nous envisageons ainsi si le 
travail que nous réalisons ensemble est concluant de la mettre à la 
disposition de la communauté internationale.

Il n'y a actuellement qu'un petit nombre de photos de feuilles qui ont 
été soumises. Nous vous proposons donc d'assouplir un peu le protocole 
pour la soumission des images (aussi bien pour des scans que des photos) en:
- ne vous limitant pas à soumettre seulement des feuilles de grandes 
dimensions, mais des feuilles de toutes dimensions,
- en ne vous contraignant pas sur les cadrages à effectuer pour la 
soumission d'images, vous permettant ainsi de soumettre des images avec 
un recadrage plus ou moins important autour des feuilles.

Nous vous rapellons, qu'il est important de couper la feuille à 
photographier ou a scanner de la tige sur laquelle elle est insérée, 
afin de la disposer sur un fond uniforme et d'éviter ainsi le 
recouvrement avec d'autres feuilles. Il est par exemple conseiller de 
disposer la feuille à photographier sur une feuille de papier blanc, 
propre et sans carreau. Il est important de la disposer sur une surface 
plane afin de réduire les ombres possibles qui pourraient apparaitre.

En ce qui concerne les efforts de collectes que nous pensons appropriés 
à realiser, nous vous proposons d'orienter ces efforts vers les espèces 
de la liste 1, pour lesquelles les % d'identification correctes restent 
encore faibles. Ceci suppose que nous ne disposons sans doute pas encore 
assez d'images pour couvrir la variabilité des formes de feuilles de ces 
espèces. Il s'agit des espèces suivantes:
Acer negundo L.
Arbutus unedo L.
Betula pendula Roth
Castanea sativa Mill.
Crataegus monogyna Jacq.
Diospyros kaki L.f.
Eriobotrya japonica (Thunb.) Lindl.
Ficus carica L.
Juglans regia L.
Laurus nobilis L.
Quercus coccifera L.
Phillyrea angustifolia L.
Pistacia terebinthus L.
Syringa vulgaris L.

En ce qui concerne les efforts de collecte sur les espèces de la liste 
2, au regards des enregistrements que vous avez effectués, et de ceux 
que nous avons également réalisés au laboratoire et qui ne sont pas 
encore intégrés dans le démonstrateur en ligne, nous suggérons de 
poursuivre les collectes sur les espèces suivantes:

Acacia dealbata Link Mimosa
Ailanthus altissima (Mill.) Swingle Ailante
Alnus glutinosa (L.) Gaertn. Aulne glutineux
Buxus sempervirens L. Buis
Cotinus coggygria Scop. Arbre à perruques
Euonymus latifolius (L.) Mill. Fusain à larges feuilles
Fraxinus excelsior L. Frêne commun
Ilex aquifolium L. Houx
Melia azedarach L. Lilas des Indes
Phillyrea latifolia L. Filaire à feuilles larges
Punica granatum L. Grenadier
Quercus robur L. Chêne pédonculé
Quercus suber L. Chêne-liège
Rhus coriaria L. Sumac des corroyeurs
Sambucus nigra L. Sureau noir
Styrax officinalis L. Aliboufier
Tilia platyphyllos Scop. Tilleul à grandes feuilles
Tilia tomentosa Moench Tilleul argenté
Ulmus minor Mill. Orme champêtre
Ziziphus zizyphus (L.) Meikle Jujubier
Rhamnus alaternus L. Nerprun alaterne
Robinia pseudoacacia L. Robinier faux-acacia
Sorbus domestica L. Sorbier domestique
Persea americana Mill. Avocatier
Bupleurum fruticosum L.

Nous tenons à tous vous remercier très sincèrement pour vos 
contributions, et vous proposons de vous faire un point régulier sur les 
collectes afin de vous tenir informé de l'avancement de celles-ci.
Très bonne journée à tous, bien cordialement, Pierre Bonnet.


Accueil Tela Botanica a écrit :
> Bonjour à tous,
>
> Je constate que le WE a été propice au test du démonstrateur... Quel 
> plaisir de découvrir un outil élaboré collectivement !
>
> Pour apporter quelques réponses et/ou compléments aux derniers 
> échanges, et permettre à chacun de contribuer au projet :
> *
> Comment participer au projet ?*
> Certains participants s'étant inscrits après octobre 2009, il me 
> semble utile de rappeler les objectifs du projet ainsi que les liens 
> utiles pour contribuer au projet.
> Objectifs du projet 
>  
> : constitution d’une banque d'images de feuilles d’arbres présents en 
> France
> Comment participer ? 
> 
> La contribution des membres du réseau se résume en trois étapes :
> - JE *COLLECTE* des feuilles d’arbres parmi les listes d'espèces 
>  
> (simples à identifier) proposées dans ce projet
> - JE *SCANNE* mes feuilles OU je *PHOTOGRAPHIE* mes feuilles
> - J’*INTÈGRE* les images dans le démonstrateur
> Voir le *mode d’emploi du projet 
>  
> *
> => Toutes les informations sont disponibles sur le wikini 
>  
> (espace de travail collaboratif) et sur le porte-document 
>  
> du projet.
>
> *Suivi du projet *
> Comme Rudy l'a mentionné, nous avons mis en place un tableur partagé 
> sous Google doc pour permettre un suivi collectif du projet. Plus 
> besoin d'ajouter vos contributions dans un wikini comme l'année 
> dernière, mais dans le tableur partagé, ce qui offre l'avantage de 
> faire automatiquement le total des plantes scannées et/ou photographiées.
> Pour ajouter ses contributions, il suffit de cliquer sur les liens 
> indiqués dans la page Liste espèce 2010 et contributeurs 
>  
> :
> /Pour compléter le tableau des contributions (liste 1)/ : 
> https://spreadsheets.google.com/pub?key=0AsyPCTS-bdYmdEllZi10Q3hKNFZBTE15aVk2OHM1eVE&hl=fr&single=true&gid=0&output=html 
> 
> /Pour compléter le tableau des contributions (liste 2) /: 
> https://spreadsheets.google.com/pub?key=0AsyPCTS-bdYmdEllZi10Q3hKNFZBTE15aVk2OHM1eVE&hl=fr&single=true&gid=1&output=html 
> 
> Il vous suffit ensuite de cliquer sur "Modifier cette page", en bas de 
> la page, pour être en mode éditeur. Le tableur visible dans la page 
> wikini permet ainsi à chacun de visualiser l'avancée des contributions.
>
> *Ajout d'espèces *(hors liste 1 et 2)
> Comme l'a indiqué Pierre dans un message précédent 
> (Message_Poursuite_travaux_2010-2011 
> ), Si 
> vous souhaitez proposer et soumettre pour une version ultérieure, des 
> images d’espèces qui ne seraient pas déjà dans cette liste, vous 
> pouvez le faire en écrivant directement le nom de l’espèce en question 
> dans la liste des espèces possibles. Nous vous suggérons cependant de 
> vous restreindre à des espèces ligneuses, pour lesquelles vous pouvez 
> soumettre au moins 20 images (scans ou photos) par espèce, et pour 
> lesquelles vous êtes certain de l’identification.
>
> *A propos du démonstrateur*
> L'outil Plantscan est encore en expérimentation. C'est d'ailleurs pour 
> cela que nous n'avons pas encore communiqué sur les résultats de ce 
> travail (une actu paraîtra à partir de septembre sur Tela). L'équipe 
> Pl@ntNet souhaite avant s'assurer que tout fonctionne bien.
> Ainsi, tous les retours que vous faites actuellement seront 
> extrêmement utile et permettront d'améliorer l'outil. Mais vacances 
> oblige ;-)), notre réactivité ne sera peut-être pas immédiate. C'est 
> pourquoi je vous propose d'indiquer sur une page wikini que je viens 
> de créer pour intégrer tous les bugs et/ou améliorations de l'outil 
> que vous notez, ceci pour éviter les doublons.
> Retours sur l'outil Démonstrateur 
> 
> Ruddy, comme tu as l'air très calé en informatique, je te propose de 
> t'assurer de la mise à jour de cette page (avec ton accord bien sûr...) !
>
> *D'autres informations ?
> *Tous les inscrits au projet sont invités à participer. Si certaines 
> explications vous semblent encore peu claires, si vous n'arrivez pas à 
> utiliser le démonstrateur.. n'hésitez pas à interroger la liste de 
> discussion scan_feuille@t... Je ne doute pas que les 
> "anciens au projet" pourront vous guider !
>
> -- 
> 	*Marie Picard*
> Responsable de l'animation de réseau et de la communication
> Tela Botanica
> Tél : 04 67 52 41 22
> www.tela-botanica.org
>
> Soutenez le réseau ! 
>