Flore électronique

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Détermination des plantes assistée par ordinateur : le projet XPER Botanica

Ce projet a pour but de concevoir, réaliser puis tester des outils de déterminations des plantes à base de tables de description des végétaux dans différents contextes (Internet, micro, PDA), permettant également la génération automatique de clefs d'identification voire de descriptions "dynamiques".

Ce projet est réalisé en collaboration avec le Laboratoire d'Informatique et Systématique (LIS) de Jussieu (Paris VI) sur financement du Ministère de la Recherche.

L'idée, à terme, est de compléter, voire remplacer, une flore de terrain par un PDA (palm ou Pocket PC) disposant d'un système d'identification fonctionnant par bases de connaissances interconnectées, contenant pour chaque plante les caractérères discriminants, des illustrations, la répartition géographique et écologique actualisée...

Le projet est ambitieux : compléter les données pour chaque taxon... et obtenir un outil de détermination innovant et fiable.

Afin de faciliter la diffusion la plus large possible de ces connaissances, les outils développés seront tous sous licence libre GNU/GPL, et aucun des partenaires du projet n'en fera une source de profit.

Démonstration des possibilités offertes par le logiciel XPER

Le logiciel Xper botanica est actuellement en cours d'évolution et de développement mais vous pouvez d'ores et déjà en tester le fonctionnement sur la base de données des Pins de France. Autrement dit il vous est déjà possible d'identifier les 25 espèces de pins présentes en France. Pour ce faire vous devrez télécharger sur votre ordinateur la machine virtuelle JRE (Java Runtime Environment) nécessaire au fonctionnement du logiciel XPER2. Nous vous proposons de le télécharger sur le site officiel de Java.
Une fois Java installé vous pourrez cliquer ci-dessous sur le lien "Identification des pins avec Xper² en ligne". Java Web Start devrait alors être lancé et l'application Xper² chargée automatiquement sur votre ordinateur. La base de données d'identification des Pins est opérationnelle et vous pouvez l'utiliser.

Identification des pins avec XPER² en ligne

La base de données sur les Pinus (fam. Pinaceae) regroupe les espèces présentes en France métropolitaine, y compris certaines espèces qui y ont été introduites (25 taxons, 20 descripteurs répartis dans 6 groupes). Cette base a été complétée et mise à jour par Sabine HENNEQUIN d'après la base originale de Régine VIGNES.

Il est aussi possible de voir les fiches descriptives générées en ligne par ViewXper : liste des fiches descriptives des espèces

Cette base sur les pins n'est qu'un début. D'autres bases sont en cours: Sorbus, Salicacées, Cistaceae, Juniperus, Coronilla, Hippocrepis, Geranium, Erodium, ... Et certaines sont déja utilisables via les fiches d'identification eFlore, ou directement ici (cf menu Bases disponibles). Elles sont parfois incomplètes, l'auteur n'ayant pas toutes les données, et vous pouvez compléter ou indiquer vos remarques (cf menu Vos remarques).

Exemple: Le travail sur la base des Dipsacales a débuté en juillet 2005 sous la supervision scientifique de Valéry MALECOT. C'est lui qui a établis le système descriptif de cette base, et Manon PECHBERTY l'a saisie : 94 taxons, 49 descripteurs répartis dans 7 groupes. Cette base est en cours de saisie, ainsi les 94 taxons possèdent tous les états possibles. Vous pouvez la tester en cliquant sur le lien suivant : la base des Dipsacales

Nous avons besoin de vous !

Si, comme nous, vous trouvez ce projet passionant et digne d'intérêt, vous êtes le bienvenu pour y apporter votre pierre !

Comment participer ?

Selon vos envies, vos disponibilités et vos possibilités vous pouvez choisir différents niveaux de participation :

• participer à la traduction du thésaurus Prometheus Project afin d'obtenir une Ontologie Botanique en français (cf Projet Ontologie), lexique structuré traitant le domaine de la botanique. Projet également ambitieux...
• fournir des données sous forme de tableau Excel comprenant les critères décrits, pour chaque espèce (critères X espèces).
• vous pouvez compléter une base déjà mise en place (cf Bases disponibles) et décrire les taxons qui en font partie sur la page Vos remarques.
  
• vous pouvez réaliser une base de connaissance sur un groupe de plantes qui vous tient à coeur. La démarche implique d'établir une liste des espèces cibles, une liste des caractères morphologiques nécessaires pour discriminer ces taxons ainsi que la liste des différents états de ces caractères.
  

Vous trouverez sur l'espace collaboratif du site du projet plus de détails et d'explications sur la démarche pour participer: espace du projet XPER Botanica.

N'hésitez pas à poser des questions au coordinateur du projet.