Vous avez un projet ? Nous avons des millions de données d’herbiers à vous proposer !

Appel à projets de recherche / Pour la quatrième année, la plateforme Les Herbonautes lance son appel à projets pour contribuer à vos programmes de recherche.

A ce jour, presque 10 millions de spécimens d’herbiers ont été numérisés et mis à disposition par
l’infrastructure de recherche RECOLNAT. Couvrant 350 ans de récoltes sur tous les
continents, ces collections d’herbier constituent une source exceptionnelle de données historiques
et actuelles sur la biodiversité mondiale. L’information figurant sur ces planches est utilisée par des projets scientifiques qui vont de la taxonomie aux études sur l’évolution des habitats et des espèces liés aux changements climatiques jusqu’à l’histoire des sciences, la paléobotanique, la médecine etc.

Spécimen de Pulsatilla vernalis de l'herbier du Conservatoire Botanique national Alpin
Spécimen de Pulsatilla vernalis par l'herbier du Conservatoire Botanique national Alpin, licence CC-BY

Depuis la création de la plateforme fin 2012, Les Herbonautes ont informatisé plus de 350 000 spécimens comptabilisant plus de 4,5 millions de contributions.
Suite au programme de numérisation e-ReColNat (ANR-11-INBS-0004), les images d’une partie des collections de 44 institutions détentrices d’herbiers sont disponibles pour la recherche. Environ 60% des spécimens conservés en France sont aujourd’hui accessibles en ligne.
La plateforme Les Herbonautes propose de transcrire les informations contenues sur les étiquettes de ces herbiers afin de constituer des jeux de données pour vos travaux de recherche.
Toutes les thématiques peuvent être abordées (systématique, écologie, histoire, géographie, chimie etc.). Elles seront examinées par le comité scientifique de l’infrastructure. Tous les projets lauréats bénéficieront de la redocumentation participative d’une communauté experte depuis 7 ans.

Comment intégrer mon projet sur Les Herbonautes ?

Les lauréats de l’appel pourront présenter une ou plusieurs “missions”. En effet, les images
proposées à la retranscription sont rassemblées sous forme de missions thématiques regroupant de 1 000 à 6 000 images.

Une mission possède :

  • un texte de présentation vulgarisé qui explique la thématique de la mission et et le programme de recherche qui utilisera les données
  • un lot d’images : pour constituer ce lot nous disposons d’une recherche par taxonomie, par continent et éventuellement par OCR. Ce lot peut être constitué avec les images d’une ou plusieurs institutions
  • un modèle de questions pour l’acquisition des données. Les informations contenues sur une
    étiquette d’herbier sont diverses, sur Les Herbonautes nous disposons d’un modèle de base pouvant inclure les champs : pays, région, récolteur, déterminateur, localité, géolocalisation, numéro de récolte, herbiers propriétaires. Nous pouvons aussi créer des questions sur mesure en fonction de votre besoin.

Il est possible également de créer plusieurs missions successives afin d’affiner les données
recherchées : une première mission peut permettre de trier, par exemple par pays, récolteur, période, etc. et une seconde permettra la retranscription des informations souhaitées d’un lot d’images ciblé.

La meilleure façon de comprendre le fonctionnement du site est de s’inscrire et
commencer à participer à l’une des missions !

Modalités de participation

Merci d’envoyer votre projet avant le 31 mars 2020 à contact@recolnat.org avec en sujet
« LesHerbonautes2020 ». Il doit contenir :

  • une présentation de votre projet (PDF) décrivant celui-ci, les données recherchées (taxonomie, géographie, histoire, etc.) ; si besoin de création de nouveaux champs, spécifiez lesquels, et en quoi la plateforme Les Herbonautes pourrait vous être utile
  • un texte de présentation grand public (PDF) qui sera diffusé sur la plateforme accompagné de photographies illustrant votre sujet
  • une proposition de calendrier pour le déroulement de la mission.

Le candidat dont le projet est retenu s’engage

  • à suivre le déroulé de sa mission sur la plateforme lesherbonautes.mnhn.fr
  • à informer l’équipe des Herbonautes de toute
    utilisation des données issues du programme : publications,
    communications etc.
  • à mentionner l’acronyme du programme “E-RECOLNAT-ANR-11-
    INBS-0004” dans toutes les publications et supports de
    communication réalisés à partir des données recueillies via Les
    Herbonautes.

La plateforme Les Herbonautes s’engage

  • à accompagner le candidat à la prise en main de la plateforme
  • à mettre en place la mission et à animer la communauté des
    Herbonautes
  • à faire parvenir au candidat un fichier d’export (format csv) des données renseignées par les participants.

Les critères de sélection sont

  • la pertinence du sujet
  • la faisabilité en termes des données recherchées et de calendrier.

Une fois les lauréats sélectionnés par le comité scientifique de l’infrastructure, un calendrier de
passage sera défini pour une programmation des missions harmonieuse selon les différents sujets proposés.

Renseignements

Contact - Infrastructure de Recherche RECOLNAT
Marc Pignal
Directeur de l'infrastructure de Recherche RECOLNAT
Véronique Schäfer
Animatrice Les Herbonautes

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