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Philippe JAUZEIN présente rapidement son atlas descriptif de la Flore d’Île de France édité par QUAE avec la publication prochaine du tome 2 contenant les clés d’identification. Sous réserve de la signature d’une convention avec NatureParif il pourrait consacrer 2 à 3 jours par semaine à la réalisation du volet botanique du projet FLORIF.
Thierry PERNOT présente Flora Bellissima, le système d’aide à la détermination des plantes communes de France qu’il a développé en 2010 (1 475 taxons). Il présente notamment le dispositif qu’il a développé pour affecter les caractères morphologiques des plantes avec la stratégie qu’il a mise en œuvre pour sélectionner les taxons qui correspondent le mieux aux valeurs observées par l’utilisateur de l’outil. Le système de FB est conçu pour la botanique, et donc pour de larges corpus de données. Celles-ci sont regroupées en trois niveaux : familles (ou groupe de familles) – genres et espèces. 22 critères généraux s’appliquent à toutes les espèces et 7 questions initiales orientent le choix des questions ultérieures. Le temps nécessaire pour affecter les caractères a été évalué à 40 minutes par taxon.
Régine VIGNE présente le système XPER dans sa version actuelle (XPER 2) et à venir (XPER 3). Elle illustre son propos au travers de plusieurs exemples d’applications (Escargots de France, Coraux des Mascareignes). Julien TROUDET, stagiaire dans son labo présente le portage sur smartphone Android de l’application XPER 2 sur la détermination des escargots de France réalisée par Olivier GARGOMINY (INPN). La version XPER 3 sera collaborative et accessible via une interface Web dans le courant de l’année (juin). XPER dispose de très nombreuses fonctionnalités pour affecter, présenter, trier, importer et exporter les caractères. Pour les corpus importants de données, la stratégie proposée est de scinder le systèmes en plusieurs sous-systèmes indépendants.
Pierre BONNET présentes divers travaux et outils développés dans le cadre du projet Pl@ntNet en partenariat avec Tela Botanica : catalogues des cépages français et des plantes de la Réunion avec l’agrégateur de données Datamanager, l’application BIOTIK d’aide à la détermination des arbres du Gath (Inde) sur tablette, le système Identify appliqué à la détermination de feuilles d’arbres, l’application de saisie de données d’observations de terrain sur smartphone (Android et iPhone), la bibliothèque IDAO de schémas représentatifs de caractères morphologiques.
Nota : Une application récente vient d’être mise sur la marché concernant la flore de Suisse : Flora Helvetica fonctionnant sur smartphones (Andropid et iPhone) et qui sera a étudier de près. Voir plus d’infos sur les actus de Tela : http://www.tela-botanica.org/actu/article5478.html
- rédaction du cahier des charges de FLORIF. Rédigé sous la responsabilité de NatureParif, il sera piloté par Laure T. avec l’apport de l’ensemble des membres du Comité de pilotage. La date de rendu est fixée au 1er février 2013.
- schémas illustratifs des caractères morphologiques : Pierre B. voit avec son unité la possibilité d’utiliser une partie de ces schémas pour FLORIF. Il transmettra, si accord de l’AMAP, les schémas disponibles à Philippe J. En contrepartie de leur utilisation pour FLORIF, Philippe J. transmettrait à AMAP les schémas manquants qu’il aura réalisé.
-Â Comparaison des listes de taxons de Flora Bellissima et ceux dÂ’ĂŽle de France. Thierry P. et Philippe J. transmettent Ă Tela Botanica (Delphine C.) leurs listes respectives (avec synonymie) pour Ă©valuer le pourcentage de recoupement entre les listes.
-Â Veille technologique : chacun sÂ’efforcera de mettre en ligne dans lÂ’espace collaboratif du projet FLORIF toutes informations utiles sur les applications smartphone pouvant aider Ă lÂ’avancement du projet (type dÂ’application, support dÂ’utilisation, liens Internet, avis dÂ’utilisateurÂ…)
Prochaine échéance : validation du cahier des charges le 1er février.
RĂ©union du 10 janvier 2013 - Paris LIS
Participants : Philippe JAUZEIN (Botaniste, AgroParisTech), Régine VIGNE (LIS, Jussieu Paris VI), Laure TURCATI (NatureParif), Delphine CAUQUIL (Tela Botanica), Jérémy SALINIER (Tela Botanica), Daniel MATHIEU (Tela Botanica), Pierre BONNET (AMAP, Pl@ntNet), Thierry PERNOT (Yourprojetct, Flora Bellissima)Exposés
Discussion préalable : après une présentation rapide du projet FLORIF porté par NatureParif (Daniel M. et Laure T.), la première heure a été consacrée à une discussion entre les participants sur les choix préliminaires qu’il conviendra de faire pour la réalisation de FLORIF avec leurs contraintes en termes de développement informatique (langages informatiques, système d’exploitation, connectivité…), de choix de système physique (smartphones, tablettes, PC) et de stratégie d’utilisation (articulation entre version PC et mobile). A également été discuté le niveau d’indépendance et les relations entre : les données botaniques – le moteur de recherche – les interfaces de consultation. Ces éléments seront repris dans le cahier des charges qui sera réalisé en janvier (cf. relevé de décision).Philippe JAUZEIN présente rapidement son atlas descriptif de la Flore d’Île de France édité par QUAE avec la publication prochaine du tome 2 contenant les clés d’identification. Sous réserve de la signature d’une convention avec NatureParif il pourrait consacrer 2 à 3 jours par semaine à la réalisation du volet botanique du projet FLORIF.
Thierry PERNOT présente Flora Bellissima, le système d’aide à la détermination des plantes communes de France qu’il a développé en 2010 (1 475 taxons). Il présente notamment le dispositif qu’il a développé pour affecter les caractères morphologiques des plantes avec la stratégie qu’il a mise en œuvre pour sélectionner les taxons qui correspondent le mieux aux valeurs observées par l’utilisateur de l’outil. Le système de FB est conçu pour la botanique, et donc pour de larges corpus de données. Celles-ci sont regroupées en trois niveaux : familles (ou groupe de familles) – genres et espèces. 22 critères généraux s’appliquent à toutes les espèces et 7 questions initiales orientent le choix des questions ultérieures. Le temps nécessaire pour affecter les caractères a été évalué à 40 minutes par taxon.
Régine VIGNE présente le système XPER dans sa version actuelle (XPER 2) et à venir (XPER 3). Elle illustre son propos au travers de plusieurs exemples d’applications (Escargots de France, Coraux des Mascareignes). Julien TROUDET, stagiaire dans son labo présente le portage sur smartphone Android de l’application XPER 2 sur la détermination des escargots de France réalisée par Olivier GARGOMINY (INPN). La version XPER 3 sera collaborative et accessible via une interface Web dans le courant de l’année (juin). XPER dispose de très nombreuses fonctionnalités pour affecter, présenter, trier, importer et exporter les caractères. Pour les corpus importants de données, la stratégie proposée est de scinder le systèmes en plusieurs sous-systèmes indépendants.
Pierre BONNET présentes divers travaux et outils développés dans le cadre du projet Pl@ntNet en partenariat avec Tela Botanica : catalogues des cépages français et des plantes de la Réunion avec l’agrégateur de données Datamanager, l’application BIOTIK d’aide à la détermination des arbres du Gath (Inde) sur tablette, le système Identify appliqué à la détermination de feuilles d’arbres, l’application de saisie de données d’observations de terrain sur smartphone (Android et iPhone), la bibliothèque IDAO de schémas représentatifs de caractères morphologiques.
Nota : Une application récente vient d’être mise sur la marché concernant la flore de Suisse : Flora Helvetica fonctionnant sur smartphones (Andropid et iPhone) et qui sera a étudier de près. Voir plus d’infos sur les actus de Tela : http://www.tela-botanica.org/actu/article5478.html
DĂ©cisions
- création d’un groupe de travail FLORIF constituant le « comité de pilotage scientifique et technique du projet FLORIF ». Ce comité est composé pour le moment par l’ensemble des personnes présentes à la réunion. Un espace de travail collaboratif (réservé aux participants du Comité) sera ouvert par Tela Botanica. Jérémy S. en sera l’administrateur.- rédaction du cahier des charges de FLORIF. Rédigé sous la responsabilité de NatureParif, il sera piloté par Laure T. avec l’apport de l’ensemble des membres du Comité de pilotage. La date de rendu est fixée au 1er février 2013.
- schémas illustratifs des caractères morphologiques : Pierre B. voit avec son unité la possibilité d’utiliser une partie de ces schémas pour FLORIF. Il transmettra, si accord de l’AMAP, les schémas disponibles à Philippe J. En contrepartie de leur utilisation pour FLORIF, Philippe J. transmettrait à AMAP les schémas manquants qu’il aura réalisé.
-Â Comparaison des listes de taxons de Flora Bellissima et ceux dÂ’ĂŽle de France. Thierry P. et Philippe J. transmettent Ă Tela Botanica (Delphine C.) leurs listes respectives (avec synonymie) pour Ă©valuer le pourcentage de recoupement entre les listes.
-Â Veille technologique : chacun sÂ’efforcera de mettre en ligne dans lÂ’espace collaboratif du projet FLORIF toutes informations utiles sur les applications smartphone pouvant aider Ă lÂ’avancement du projet (type dÂ’application, support dÂ’utilisation, liens Internet, avis dÂ’utilisateurÂ…)
Prochaine échéance : validation du cahier des charges le 1er février.