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Sous projet 3 : Collecte des données pour la description des plantes

1. Rappel de la description prévisionnelle du sous projet 3

Au début de ce 3ème sous projet nous disposons d’une liste de plantes à caractériser à partir des caractères morphologiques établis au sous projet 1, d’un outil de saisie des données, le système XPER, et d’un serveur permettant de centraliser les informations réalisées dans le sous projet 2.

Il s’agit maintenant d’organiser le travail des botanistes de terrain pour collecter les valeurs des paramètres de chaque plante. Sur la base d’une sélection de 92 plantes et d'une centaine de caractères par plante, il faut donc collecter et valider environ 9 000 informations élémentaires.
  • Objectifs : Disposer du tableau des valeurs des 8 000 paramètres qui serviront Ă  constituer la base de connaissance du groupe de plantes tests.
  • DurĂ©e : 4 mois

2. Réalisation du sous-projet 3

L'objectif de ce sous-projet était d'assurer la collecte des données de la base de connaissance. Il s'agissait donc d'obtenir la coopération des botanistes du réseau de Tela Botanica. La mobilisation de ce réseau était indispensable pour remplir les fiches descriptives préparées dans le sous-projet 1. Pour amorcer la participation, Tela Botanica apporte les fonctionnalités de ses outils en réseau (wikini, groupe de discussion, outil de mis en relation)

L'appel Ă  participation


Objectifs non atteind: 15 fiches/92, 16 contributions, 6 participants

Reflexions et analyse sur le déroulement de ce sous projet

Les outils

La saison

La coopération

  • les freins
  • les coopĂ©rations spontannĂ©es: Rosa et illustrations
Cl : La coopération est difficilement prévisible, on ne peut prédire si elle se passera comme on le souhaite différement ou pas du tout

Propositions d'améliorations
Outils adapté à la saisie et à l'aggrégation des données (pr des questions de visisbilité et de résultats exploitable)
Besoin de poursuivre le travail sur les caractéres morphologiques avec illustrations (Thésaurus)
Besoin de groupes de plantes HOMOGENE (revoir discussion sur l'ILOT)

Cl et perspectives
2.1 Etapes de l'appel Ă  participation
Etape 1 : Création d'un "atelier" sur le site de Tela-Botanica
  • Wikini, liste de diffusion dĂ©diĂ©e aux participants etc
Etape 2 : Appel Ă  participation
  • Envois d'un mail Ă  tous les adhĂ©rents du rĂ©seau Tela-Botanica (texye du mail Ă  insĂ©rer)
Etape 3 : Récolte des réponses
  • Peu de participation : 0.004% ont rĂ©pondu positivement Liste des participants
  • Peu de retour (3)
  • Peu d'enthousiasme (dĂ©couragement face Ă  la masse de travail)
  • Profil type : retraitĂ© botaniste
2.2 Analyse des résultats
  • Contraintes liĂ©es Ă  l'ordre des Dipsacales (cf. Conclusion du sous projet 1)
  • Contraintes liĂ©es Ă  l'outil XPER Liste des amĂ©liorations Ă  faire sur XPER
    • Ergonomie
    • Bugs nombreux
    • Obligation de tĂ©lĂ©charger (freins pour le public)
    • Lors de l'appel Ă  projet impossibilitĂ© d'aggrĂ©ger les observations dans la BC
    • ambiguĂŻtĂ© opĂ©rationnelle liĂ©e Ă  la confusion entre « vrai » et « inconnu »

3. Conclusions et perspectives

Les objectifs n'ont pas été atteint: La BC de l'ordre des Dipsacale n'a été remplie que pour quelques taxons Liste des taxons (individus). Ceci s'explique par l'ensemble des contraintes énumérées précédement.
Toutefois l'utilisation de XPER pour créer la BC nous a amené à revoir l'organisation des descripteurs. On s'aperçoit qu'on aurait intérêt à se placer sur un système "où regarde-t-on?" et "quel caratère regarde-ton". Par exemple le caractére "couleur de " ou "taille de " peut être utilisé à plusieurs endroit de la morphologie de la plante.
Faire un schéma ancienne vs nouvelle organisation

Ce système présente plusieurs avantages:
  • S'applique Ă  tous les BC de botanique: ordre, genre, famille
  • Pas besoin de spĂ©cialiste en botanique pour dĂ©terminer les caractĂ©res descriptifs nĂ©cessaire Ă  la BC choisie
3.1 Nouveaux objectifs
Etape 1 : Cibler un public plus large (ex: étudiant)
  • Besoin d'Ă©tablir un dictionnaire complet et illustrĂ© sur les descripteurs utilisĂ©s
Etape 2 : Motiver ce public
Pour attirer des botaniste vers le projet il importe de rendre visible ce que l'on peut faire avec XPER en matière de restitution des données.
  • Exploiter tous les utilitaires disponibles d'XPER Ă  partir d'un exemple concret
Etape 3 : Simplifier la démarche
Le modèle XPER2 ne permet pas de répondre à notre nouvelle organisation, ce que fera en revanche le modèle XPER3. Par exemple,actuellement, XPER2 ne permet de saisir le caractère "couleur de", mais on devra répéter "couleur de la feuille", "couleur de la tige', ...
Par conséquent nous avons choisi de s'affranchir de l'outil XPER en attendant une version plus opérationnelle.
3.2 Perspectives concrètes
pour l'étape 1:
Coopératon possible avec l'équipe et les étudiants d'ID-Bio

Pour l'etape 2:
Réalisation des descripteurs pour le genre Pinus, plus exploitation de cette BC avec tous les utilitaires creés par le LIS
voir JP ou il en est, plus la fig 5 du rapport du LIS

Pour l'étape 3:
  • RĂ©alisation d'un thĂ©saurus des descripteurs selon la classification de Radford
  • Constitution d'un dictionnaire et d'illustrations des descripteurs utilisĂ©s en se basant sur le dictionnaire de Gatin

Etat d'avancement : en cours
Cf. Thésaurus et définition des termes http://www.tela-botanica.org/papyrus.php?site=3