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But : rendre fichiers compatibles à leur intégration dans la bdd
But :Vérifier la cohérence des fichiers
But :Intégration des fichiers dans Bibliobota
Si pb, trouver d'ou ca vient (comparer avec les tables des cas similaires qui fonctionnent):
-erreur de champs de domaines-lier, ...
- mettre "serie 1" meme si une seule, si "pas de série" ce qui arrive étage en dessous n'apparaitra pas...
! se mettre dans le bon moteur de recherche
sinon, faire appel Ă JP.
Mode d'emploi : comment alimenter la base de données bibliobota ?
Etape 1 : Recolte des données
- Recolter l'information sur les fiches suivantes : fiches http://www.tela-botanica.org/papyrus.php?site=3&id_projet=6&act=documents fiches
- Pour les revues
- Pour les livres
- Catalogue Librairie Thomas (juin et novembre)
- Livres mentionnés aux dernières pages de la Garance Voyageuse
- Tous les livres mentionnés dans la rubrique "en kiosque" des actualités de la botanique
- Catalogue FRAPNA, CPN, BIOTOPE ...
- Pour les publications du RĂ©seau Tela Botanica
- Indexer les nouvelles "synthèses des forums" et nouveaux "articles en ligne" situés dans le monde "Parlons Botanique"
- OĂą en est-on de la mise Ă jour ?
- Pour les revues
- RĂ©ponse ici :http://www.tela-botanica.org/papyrus.php?menu=391.
- Relancer les interlocuteurs s'ils n'envoient pas d'eux mêmes les fichiers mentionnés ci-dessus
- Pour Adansonia, il faut nous même chercher les revues sur le site du museum d'histoire naturelle :http://www.mnhn.fr/museum/foffice/science/science/DocScientifique/publications/presentation/fichePublication.xsp?PUBLICATION_ID=5&idx=23&nav=publication. Par ailleurs, Adansonia fait suite depuis 1997 au Bulletin du Muséum national d'Histoire naturelle, section B, Adansonia, Botanique, phytochimie. Il faudrait référencer cette collection
- Pour les livres, publications du réseau Tela Botanica
- Pour les revues
Etape 2 : Constitution d'une base sur excel
- Fichier vierge : modele_BDD_vrai.xls
- Conseils pour remplir ce fichiers :
- Vérifier que le fascicule, article ou média qu'on souhaite indexer ne l'est pas déjà dans : http://www.tela-botanica.org/biblio
- Pour comprendre ce qu'il faut remplir dans les champs, voir l'application Biblio Bota: http://www.tela-botanica.org/wikini/site/wakka.php?wiki=AppliBiblioBota
- On peut consulter la Bdd bibliobota : http://sql.tela-botanica.org/
- Souvent, on demande le temps en seconde. Il faut alors allez sur ce site de conversion http://www.onlineconversion.com/unix_time.htm
Etape 3 : Migration de la base excel vers bibliobota
But : rendre fichiers compatibles à leur intégration dans la bdd
- Pour chacun des onglets, faire "enregistrer sous" au format .txt (NB : seul l'onglet actif sera enregistrer).
- Lors de l'enregistrement, choisir les options suivantes:
- Jeu de caractère : Europe occidentales (ISO 8859-15 /Euros)
- Separateurs de cases : {tab}
- SĂ©parateur de texte : (vide)
- Pour chacun des fichiers obtenus (structure.cvs , collection.cvs, serie.cvs, fascicule.cvs, item.cvs, article.cvs, media.cvs, domaine_lier.cvs, lien.cvs), l'ouvrir dans un editeur de texte type Scite
- Supprimer les lignes en trop, et le ligne des champs (attention, c'est très important)
- Lors de l'enregistrement, choisir les options suivantes:
But :Vérifier la cohérence des fichiers
- Il y a la possibilité de vérifier qu'on a un fichier cohérent en utilisant un logiciel Perl
- Ouvrir une console et se loguer en root
- cd /home/helene/Applications/bibliobota/
- ./Reper_caracteres_spec.pl
- Il faut ensuite répondre aux questions :
- Indiquer sucessivement les chemins des fichiers structures.cvs, collection.cvs, ....
- Indiquer le nombre de colonne que contient la table Mysql correspondant au fichier (21 pour Structures, 16 pour collection, 6 pour série, 11 pour fascicule, 15 pour item, 6 pour article, 12 pour média, 2 pour domaine_lier, 12 pour lien)
- NB : il est conseiller de rapatrier le programme Repere_caracteres_spec.pl dans son /home propre
- Ouvrir une console et se loguer en root
But :Intégration des fichiers dans Bibliobota
- Par précaution, exporter des tables de la bdd sur lesquelles on va travailler
- Se rendre sur sql
- Dans le menu de gauche, choisir parmi la liste déroulante : tela_prod_bibliobota,
- Cliquer sur l'onglet "exporter"
- Choisir les tables qu'on souhaite exporter, et vérifier que "Sql" a été coché
- Cocher "transmettre" et choisir de compresser sous forme "zippé"
- Valider la manipulation en cliquant sur "exécuter"
- Aller sur http://sql.tela-botanica.org/
- Cliquer dans le menu gauche sur la table oĂą on souhaite rajouter le fichier (ex : biblio_article)
- Aller dans l'onglet "Structure" et cliquer tout en bas sur "Insérer des données provenant d'un fichier texte dans la table"
- indiquer adresse fichier
- Cocher "champs terminés par : "\t"
- Lignes terminées par : "\n"
- Caractères spéciaux : \
- Cliquer sur "exécuter"
Etape 4 : Vérifier que les données ont été correctement indexées
En réalisant plusieurs recherche dans http://www.tela-botanica.org/bilbio/ sur les livres, revues, ... qu'on vient d'indexer.Si pb, trouver d'ou ca vient (comparer avec les tables des cas similaires qui fonctionnent):
-erreur de champs de domaines-lier, ...
- mettre "serie 1" meme si une seule, si "pas de série" ce qui arrive étage en dessous n'apparaitra pas...
! se mettre dans le bon moteur de recherche
sinon, faire appel Ă JP.
Etape 5 : Annoncer la mise Ă jour de la bdd
- Aux fournisseurs de données et à tous :- Faire un article dans les actualités de Tela Botanica, du style : http://www.tela-botanica.org/actu/article598.html