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Introduction à la notion de projet


Introduction

Un botaniste peut réaliser différentes manipulations sur un taxon. En voici la liste :
  • 1. décrire un nouveau taxon : provoque l'apparition d'un nouveau nom et d'un type nomenclatural.
  • 2. rassembler plusieurs taxons : provoque la mise en synonyme taxonomique de plusieurs taxons, possédant chacun leur type nomenclatural.
  • 3. dissocier plusieurs taxons en plusieurs nouveaux taxons : provoque l'apparition de nouveaux noms et de types nomenclaturaux. On aura éventuellement aussi la création d'autonyme.
  • 4. changer le rang ou la position d'un taxon : provoque l'apparition d'un nouveau nom a relier à son basionyme.
  • 5. redécrire un taxon décrit précédement par un autre auteur : c'est le tavail effectué par les auteurs de flores.

Un botaniste travaille en:
  • en révisant un groupe taxonomique précis (jusqu'au règne...)
  • sur une zone géographique donnée (jusqu'au niveau mondial)
Dans les publications, on peut isoler 4 types différents, du plus simple au plus complet :
  • 1.les articles de botaniste : proposant des choix taxonomiques.
  • 2.les index ou catalogues : reprenant des choix taxonomiques pour un ou plusieurs groupes sans forcément les lier tous entre eux.
  • 3.les classifications : listant tous les choix taxonomiques pour un groupe donnée, les liants entre eux et leur attribuant éventuellement de nouvelles descriptions.
  • 4.les flores : listant tous les choix taxonomiques pour un groupe donnée, les liants entre eux et leur attribuant de nouvelles descriptions.
D'une façon générale, nous pourrons noter que ces différents types s'emboite les uns dans les autres.

Nous pouvons aussi isoler deux groupes dans ses 4 types :
  • les publications où les descriptions de taxons sont obligatoires :
    • les articles de révision de groupe
    • les flores
  • les publications où les descriptions de taxons ne sont pas obligatoires :
    • les index
    • les classifications
Pour le premier groupe de publications, il est donc possible de retrouver plusieurs descriptions pour le même taxon.
Ces decriptions sont donc comparables.

Le but dans eFlore est de pouvoir :
  • stocker toutes les informations contenues dans ces publications.
  • réaliser l'équivalant d'une publication directement dans eFlore
  • stocker les données issues de standards pour pouvoir les utiliser

Nous venons de définir  ici les différents types de projet de données stockables dans eFlore.
Nous pouvons donc essayer de classer toutes les publications scientifiques botaniques en fonction de ces types.
Mais certaines publications poseront problème car elle ne rentrerons pas complétement dans un type.

En effet, si nous conscidérons qu'une flore contient forcément des clés de déterminations, nous sommes dans l'erreur. En effet, certaines publications portant ce titre ne possède pas de clés.
Ainsi, pour qualifier réellement un projet, il faut pouvoir qualifier son contenu.
Il faut pouvoir dire cette flore possède:
  • une classification
  • des descriptions
  • des dessins
  • des clés
  • des données chorologiques...

Ainsi, le modèle d'eFlore doit permettre pour chaque projet de chaque type indiquer les types de données qu'il contient.
Voir la liste des types de données  ici .
Il doit permetre d'intégrer les choix taxonomiques des auteurs de publications et lier leurs données supplémentaires (information de chorologie, d'écologie...) à ces choix.
Nous devons aussi pouvoir créer des projets complétant les données d'auteurs de publications. Enfin, un botaniste travaillant directement dans eFlore doit pouvoir faire évoluer son projet.

Description des différents types de publications


Les publications créatrices de descriptions et de clés de détermination


Les articles botaniques

Dans un article, un botaniste va créer ou modifier des taxons. Il pourra effectuer les manipulations 1 à 4 citées dans l'introduction.

Les flores

Dans une flore, un botaniste redécrit des taxons présents sur une zone géographiques donnée. Ces taxons ont pour la plupart était proposer par d'autre auteurs. Mais l'auteur de la flore peut dedans décrire aussi de nouveaux taxons, en rassembler ou en dissocier. Il peut donc réaliser les manipulations 1 à 5 citées dans l'introduction.

Les publications non créatrices de descriptions


Les index taxonomique, catalogues, atlas...

Dans ces types de publications, l'auteur récupère les taxons issus des choix taxonomique d'autres auteur les ayant publié validement. Il attribué ensuite des données diverses (chorologie, phénologie...) à ces taxons.

Les classifications

Une classification possède des taxons issus du choix taxonomique d'un auteur l'ayant publié validement, désigne un taxon de départ puis établit des relations qui sont le plus souvent du type "est le supérieur de". Un seul taxon ne possède pas de relation "est le supérieur de", celui qui se trouve au sommet de la classification.

Notes sur la hiérarchisation des taxons :
Toutes ces publications (article, flore, index et classification) hiérarchisent leurs taxons. Nous devons donc pouvoir dans tous les projets utilisant la notion de taxon, hiérarchiser les taxons les uns par rapport aux autres en établissant des relations uniquement du type "est le supérieur de". Un ou plusieurs taxon peuvent ne pas posséder de relation "est le supérieur de" (exemple BDNFF qui contient seulement des taxons inférieurs au genre).

Les projets dans le modèle

Dans le modèle, les 3 types de projet (publication, travail et standard) seront indiqués dans la table EFLORE_PROJET_TYPE et pourront être attribué seulement à des projet ( table EFLORE_PROJET).
Chacun de ces projets pourra avoir de 0 à n version de projets possédant chacune leurs types de données. Ainsi, nous pourrons ajouter de nouvelles données avec l'évolution d'un projet.

Si nous attribuons des types de données aux versions et non aux projet, c'est qu'un projet réalisé par un botaniste directement dans eFlore peut évoluer. Par exemple, un index peut devenir une flore. Ainsi pour faire évoluer un projet, il suffira qu'il change de version et ajoute les nouveaux types de données.

Voir les pages suivantes pour la description du traitement de chaque type de projet :