Un⋅e chargé⋅e d’étude scientifique spécialisé en mycologie pour le MNHN

Les champignons sont souvent détectés dans l’environnement par des méthodes moléculaires (barcoding par amplification et séquençage du 18S ou de l’ITS). Les banques de données (Unite, GenBank…) contiennent des séquences de « référence » qui permettent d’affilier les séquences détectées aux espèces connues. Cependant, l’identification de ces références n’est pas toujours fiable et les séquences de référence manquent encore pour de très nombreuses espèces de France. Enfin, l’expertise taxonomique repose sur des mycologues amateurs éparpillés en France, dont le savoir-faire et les collections sont très mal valorisés par les institutions scientifiques, et pas toujours pérennisés.

Le projet Funif-Coll vise à produire des séquences de référence fiables, correspondant à des spécimens d’herbiers, déposés chez des privés ou au sein de l’Herbier du Muséum.

Le poste relève de la direction générale déléguée aux collections (DGD-C) qui contribue aux activités de la mission du Muséum en termes de recherche, d’enseignement, d’expertise et de diffusion. Il est situé à l’Herbier du Muséum national d’Histoire naturelle, l’un des plus anciens et des plus riches au monde, rénové en 2013. Sous l’autorité administrative de la directrice des collections naturalistes, le/la titulaire du contrat est placé/e sous la responsabilité hiérarchique de la responsable du service de conservation des collections de Botanique (Herbier du Muséum). Celles-ci comportent des collections de champignons dont le responsable scientifique est Bart Buyck.

Le poste est environné d’une équipe dirigée par le Professeur M.-A. Selosse au Muséum à Paris (équipe Interactions et évolution végétale et fongique, https://isyeb.mnhn.fr/en/interactions-and-evolution-vegetal-and-fungal-models-407), où travaille également B. Buyck. Cette équipe, dynamique, collégiale et intergénérationnelle, additionne des compétences mycologique et botanique avec des approches écologiques (notamment des symbioses mycorhiziennes et des microbiotes végétaux). Elle possède une plate-forme technique de biologie moléculaire dans ses murs et a une forte expertise en systématique et barcoding.

• collecter des échantillons lors de colloques mycologiques, en suivant des mycologues sur le terrain, ou en contactant des mycologues amateurs (en utilisant les liens et les collaborateurs d’INEVEF) ;
• générer les séquences de l’ITS et du 18S des échantillons collectés, voire pour quelques espèces à position phylogénétique douteuse, d’autres marqueurs d’intérêt (en s’appuyant sur le savoir-faire des membres d’INEVEF en biologie moléculaire et/ou en systématique) ;
• déposer et annoter dans les banques de données internationales les séquences obtenues et leur lien à des spécimens d’herbier (herbier où l’échantillon a été collecté ou bien dépôt dans l’Herbier du Muséum, sous la direction du responsable scientifique de la collection).

Compétences recherchées : 

• une expérience de gestion d’herbier ou de collection,
• une connaissance mycologique (amateur ou niveau universitaire élémentaire),
• une pratique de biologie moléculaire de base (niveau mastère ou des stages/ postes),
• une compétence bio-informatique élémentaire
• organiser des voyages pour collecter (aux frais du programme) en France métropolitaine (permis de conduire B et voiture souhaités).
• réaliser le travail de biologie moléculaire et déposer les séquences

Formation : une priorité sera donnée à l’expérience et à la motivation mais un niveau minimum M2 est souhaité.

Savoir être :

•  Rigueur, patience et minutie
•  Sens de l’organisation
•  Aptitudes relationnelles pour travailler en équipe
•  Respect des directives et des consignes de bonnes pratiques

Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.

Le contrat

• Localisation : Jardin des plantes
• Contrat : CDD de droit public de 2 ans
• Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels.
• Date de prise de fonction : 1er juin 2023

Les avantages

• Remboursement de 50% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)
• Télétravail possible jusqu’à deux jours par semaine après 4 mois d’ancienneté
• Restaurant d’entreprise
• Prise en charge partielle de votre mutuelle
• Un comité social et une association sportive et culturelle
• Accès illimité aux sites de l’établissement avec invités

Sur le site du MNHN

date limite de candidature : 23-04-2023